سومین تجربه حضور محمدجواد ظریف در پاستور، نه در قامت یک وزیر بلکه در قامت یک معاون است که قرار است رابط بین اندیشکده ها و نخبگان با دولت باشد.
درحالیکه محمدجواد ظریف یکی از محتمل ترین گزینه ها برای «معاونت سیاسی» به شمار می‌رفت، مسعود پزشکیان با صدور حکمی، او را به سمت معاونت راهبردی و ریاست مرکز بررسی های استراتژیک منصوب کرد.
مسعود پزشکیان، در این حکم انتصاب، با استناد به اصل ۱۲۴ قانون اساسی، محمد جواد ظریف را به سمت معاون راهبردی رئیس جمهور منصوب کرده و از او خواسته است که رابط بین اندیشکده ها و نخبگان با دولت باشد.
این جایگاه و سمت تا قبل از دولت چهاردهم، وجود نداشت و به نظر می رسد ایجاد چنین جایگاهی نه از باب تشریفات و تعارفات بین ظریف و پزشکیان بلکه پررنگ کردن جایگاه مرکز بررسی های استراتژیک به عنوان اتاق فکر دولت از یک سو و نقش جدی ظریف در مشورت دهی به رئیس جمهوری است. مشورت هایی متکی به نظرات کارشناسان و متخصصان و جامعه نخبگانی و دانشگاهی کشور.
این مشورت ها با حضور در مرکز بررسی استراتژیک نمود بارزتری خواهد یافت، چه آنکه مرکز بررسی‌های استراتژیک ریاست‌جمهوری یکی از سازمان‌های زیرمجموعهٔ نهاد ریاست‌جمهوری ایران است که می تواند تبدیل به «اتاق فکر» دولت شود.
در ماموریت تعریف شده برای این مرکز، بر انجام مطالعات، بررسی‌ها و پژوهش‌های راهبردی و بین دستگاهی در دولت تاکید شده و ارائه طرح‌ها و پیشنهادهای مرتبط با راهبردهای ملی در زمینه‌های سیاسی، اقتصادی، اجتماعی، فرهنگی و سیاست خارجی، با رعایت سیاست‌های کلی نظام مورد توجه قرار گرفته است.
